Le plan de gestion 2007-2011 (PG 2007-2011) adopte deux stratégies de conservation différentes pour les marais non boisés et les plans d’eau de la Grande Cariçaie :
une conservation statique pour les habitats dont on ne connait pas suffisamment l’écologie pour pouvoir les recréer ailleurs, ou dont on n’observe pas d’expansion naturelle dans les conditions actuelles. Cette stratégie de conservation concerne surtout les formes de marais les plus secs, aujourd’hui mis en danger par une absence d’inondation régulière par le lac. Par chance, ces types de marais supportent bien une intervention mécanisée régulière et on peut donc les entretenir très régulièrement pour conserver leur valeur écologique ;
une conservation dynamique pour les habitats qui montrent une capacité d’expansion dans les conditions actuelles. Il s’agit surtout des formes de marais les plus aquatiques, qui sont relativement sensibles aux mesures d’entretien. Il est donc préférable de limiter la fréquence d’interventions dans ces types de marais.
Les techniques utilisées pour atteindre ces objectifs de conservation sont expérimentées depuis de nombreuses années. Elles ont en général fait l’objet de suivis scientifiques pour documenter leurs effets sur les écosystèmes et les communautés animales et végétales. Pour limiter leur impact sur la faune, elles sont appliquées de septembre à février, sauf rares exceptions, et sur des surfaces réduites et non contigües pour permettre une recolonisation des parcelles traitées par la microfaune depuis les parcelles voisines non traitées. Il s’agit notamment :
du fauchage, qui est pratiqué avec une faucheuse prototype sur chenilles larges ou avec un équipement agricole standard. Le choix des engins et le rythme de fauche dépendent du niveau d’inondation moyen des parcelles fauchées. La matière végétale est toujours évacuée hors du marais ;
du broyage mécanique, réalisé avec un broyeur sur chenilles larges qui permet de disloquer arbres et arbustes y-compris leur système racinaire. Les débris végétaux sont laissés sur place ;
du débroussaillage manuel, réalisé par des équipes sur le terrain, mélangeant généralement professionnels et bénévoles. Les déchets de coupe sont entassés en lisière de forêt ;
du décapage dans les roselières atterries, pratiqué avec une pelle mécanique sur chenilles larges et un dumper de transport des matériaux. L’opération consiste à prélever la partie supérieure du sol, puis à laisser évoluer le plan d’eau ainsi obtenu jusqu’à retour à la roselière atterrie (le temps moyen de retour est estimé à 30 ans). Les matériaux de creuse sont évacués hors du marais ;
du creusage de plans d’eau profonds, pratiqué avec les mêmes équipements que le décapage. Il n’est pas prévu d’intervention de ce type sur la durée du PG ;
du pacage avec des bovidés de race Highland cattle, qui n’est pratiqué qu’à titre expérimental dans la réserve de Cudrefin ;
d’ensemencements de parcelles, expérimenté dans quelques secteurs, pour déterminer les possibilités de création d’habitats prioritaires dans des parcelles moins intéressante au plan biologique (zones agricoles riveraines par exemple) ;
ou enfin de la non intervention pendant la durée du PG, qui se révèle appropriée dans les secteurs évoluant peu.
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